Egyptologi
Gustavianum förvaltar två samlingar med anknytning till ämnet egyptologi.

Den egyptiska samlingen, även känd som Victoriamuseet för Egyptiska fornsaker, växte fram under professor Karl Piehl under slutet av 1800-talet. Piehl samlade själv föremål till det han hoppades en dag skulle bli ett egyptiskt museum, men framför allt växte samlingen genom donationer från bland andra dåvarande Kronprinsessan Victoria och generösa gåvor från den egyptiska staten. I samlingen ingår mumifierade människor och djur, vackert bemålade mumiekistor, textil, keramik och andra bruksföremål, samt en världsunik samling keramikskärvor med inskriptioner, så kallade ostraka.

Nubien (1961–1964).
Gustavianum förvaltar också en stor del av fynden från de samnordiska utgrävningarna i Nubien, Scandinavian Joint Expedition to Sudanese Nubia, som på 1960-talet grävde ut ett stort område i samband med att Höga dammen byggdes vid Assuan. Andra delar av samlingen finns idag i Sudan, Norge, Danmark och Finland.